Khu lưu niệm danh nhân Phan Bội Châu tại Huế có các cụm công trình chính, bao gồm: Ngôi nhà ở lúc sinh thời của cụ Phan, Lăng mộ cụ Phan Bội Châu, Nhà thờ cụ Phan Bội Châu, Từ đường, Tượng cụ Phan Bội Châu, Nghĩa trang Phan Bội Châu...
- Ngôi nhà của cụ Phan ở dốc Bến Ngự: Nhà ở của cụ Phan Bội Châu được xây dựng năm 1926, do Cụ tự thiết kế, cụ Võ Liêm Sơn - giáo viên trường Quốc Học đứng ra chủ trì xây dựng. Ngôi nhà có ba gian, tượng trưng cho ba kỳ (Bắc, Trung, Nam),nhà lợp tranh, vách đất tương đối cao và thoáng mát. Chính giữa nhà hình vuông, làm nơi diễn thuyết. Xung quanh có các chái chia phòng riêng biệt.
- Lăng mộ cụ Phan Bội Châu: Lăng mộ cụ Phan Bội Châu nằm ngay chính giữa vườn. Sau khi Cụ qua đời (29/10/1940), với số tiền phúng điếu của đồng bào trong cả nước, cụ Huỳnh Thúc Kháng đã đứng ra xây dựng ngôi mộ và nhà thờ.
Mộ có chiều dài 7m, ngang 5m, có 5 bậc tam cấp cao 0,8m, cách bình phong phía đầu mộ chừng 1m là tấm bia cao 1,8m, rộng 0,8m, trên mặt bia có bài “Tự Minh” bằng chữ Hán do cụ Phan viết năm 1934.
Nội dung bài "Tự Minh" như sau:
Đây là nhà ở muôn đời của ta, khi ta chết thì phải chôn ngay tại đây, phải tuân theo lời dặn sau này
Cấm không được khâm liệm quan quách, đắp mộ lập đền thời theo tục lệ.
Cấm không được để tang cúng tế theo lối hư văn.
Cấm không được cáo ai phó tang theo lối hư văn.
Thân bằng cố hữu vì không được biết tin ta chết, chỉ để lòng thương nhớ thôi. Phàm kẻ sau thành tâm thương ta, chỉ kế chí thuật sự, ngoài ra chả cần gì khác.
Nam lịch năm Giáp Tuất ngày ... tháng ...
Tây lịch năm 1943 ngày ... tháng ...
(Người dịch: GS. Chương Thâu)
- Nhà thờ cụ Phan Bội Châu: Do cụ Huỳnh Thúc Kháng đứng ra xây dựng năm 1941 với số tiền cúng điếu còn lại. Nhà thờ được xây dựng phía bên phải nhà ở, nguyên trước đây là ngôi nhà rường 3 gian tường gạch, mái lợp ngói liệt.
- Từ đường: Từ đường được xây dựng từ tháng 4/1955 đến năm 1956. Từ đường là một ngôi nhà ngói to lớn, đồ sộ, cao khoảng 8m, mái lợp ngói âm dương, mặt quay về phía lăng mộ cụ Phan Bội Châu. Mặt trước Từ đường có biển đề hàng chữ “Từ đường các liệt sĩ tiền bối và Phan Bội Châu tiên sinh”.
Hiện nay, Từ đường được sử dụng làm nơi trưng bày khoảng 150 hiện vật, tư liệu về cuộc đời, sự nghiệp hoạt động cách mạng của cụ Phan Bội Châu.
Kể từ năm 1987, khu di tích có thêm bức tượng đồng chân dung cụ Phan Bội Châu do nhà điêu khắc Lê Thành Nhơn thực hiện năm 1973 cùng với sự tham gia của sinh viên Trường Cao đẳng mỹ thuật. Đây là loại tượng đầu có kích cỡ lớn nhất Đông Nam Á (với chiều cao khoảng 4,5m, dày 2,5 và rộng 3,5m được ghép bằng 13 mảnh đồng nặng 7 tấn). Từ năm 2012, để phát huy giá trị nghệ thuật trong việc giáo dục tinh thần yêu nước, tượng được di chuyển về bên bờ sông Hương, gần cầu Trường Tiền tại số 19 Lê Lợi, một vị trí xứng đáng trong lòng cố đô Huế.
Ngoài ra, có thể kể đến Nghĩa trang mang tên cụ Phan Bội Châu. Đây là một khuôn viên rộng 4.000m2, tọa lạc trên đồi Quảng Tế, nay nằm tại số 5 đường Thanh Hải, phường Trường An, thành phố Huế gần đàn Nam Giao. Khu đất nghĩa trang do cụ Phan Bội Châu mua cùng thời điểm với mảnh đất làm nhà ở dốc Bến Ngự. Năm 1934, Cụ dựng bia quy định rõ tiêu chuẩn những người được chôn cất tại đây. Ở nghĩa trang hiện nay có hơn 20 mộ phần của các nhà cách mạng yêu nước như: đồng chí Nguyễn Chí Diễu, nữ sĩ Đạm Phương, nhà văn Hải Triều (Nguyễn Khoa Văn), nhà thơ Thanh Hải (Phạm Bá Ngoãn), liệt sĩ Lê Tự Nhiên,…
Cùng với những di tích chính, trong khu vực vườn nhà cụ Phan Bội Châu ở dốc Bến Ngự còn có một số di tích khác như: lăng mộ Tăng Bạt Hổ, lăng mộ ông bà Phan Nghi Đệ (con trai và con dâu của cụ Phan Bội Châu), bia kỷ niệm quan hệ giao lưu Việt - Nhật từ phong trào Đông Du, bia Ấu Triệu Lê Thị Đàn, bia con Ky, bia con Vá, giếng nước…